负责全县新型农村合作医疗资金的测算、监管和使用;参合农民住院医药费的审核和报销;参合农民家庭个人帐户及门诊报销的审核;医疗单位住院窗口结算的审核和管理;各乡镇和医疗单位网络建设管理和使用;参合农民个人档案录入及管理;新农合资金的预算及年终决算工作。